Pentru tratarea în sistemul de deoxigenare în coloană, apa este mai întâi încălzită la 72 °C sau mai mult într-un schimbător de căldură regenerativ integrat. Încălzirea reduce solubilitatea oxigenului și în același timp dezinfectează apa. Apa caldă este apoi dispersată în partea de sus a coloanei. Coloana conține foi subțiri de oțel inoxidabil dispuse în mod dens și astfel încât apa urmează mai multe căi pe măsură ce curge în jos prin coloană.

Acest lucru maximizează suprafața de transfer și timpul de contact între apă și gazul de strip (CO2 sau N2). Gazul de strip este introdus în partea de jos a coloanei și curge în sus în interiorul acesteia în contracurent cu apa. Diferența mare de presiune parțială a O2 forțează oxigenul să iasă din apă în faza gazoasă. Acest principiu științific fundamental este descris de Legea lui Henry.

În partea de sus a coloanei, oxigenul eliminat părăsește sistemul sub formă de gaz, împreună cu CO2 sau N2 nedizolvat. Deoxigenarea în coloană fierbinte necesită foarte puțin gaz de strip. Conținutul de O2 al apei deoxigenate este monitorizat permanent. Prin urmare, sistemul este echipat cu un senzor optic de înaltă precizie OXYTRANS fabricat de Centec. Centec are zeci de ani de experiență în dezvoltarea și fabricarea de instrumente de precizie proprii pentru controlul O2. Apa practic lipsită de oxigen este colectată în partea de jos a coloanei. Pentru prelucrare ulterioară, aceasta poate fi opțional răcită sau suplimentar carbonatată.